1992 — 2009

Президент Ельцин собирался как можно скорее заключить мирный договор с Японией, и к концу XX в. в совместных заявлениях стали упоминаться ещё о-ва Итуруп и Кунашир.

В XXI  в. позиции сторон были частично пересмотрены. В 2004 г. министр иностранных дел РФ Сергей Лавров заявил, что Россия как государство-продолжатель СССР признаёт декларацию 1956 года как существующую и готова вести территориальные переговоры с Японией на её базе.

Премьер-министр Японии Коидзуми ответил, что Японию не устраивает передача лишь двух островов: «Если не будет определена принадлежность всех островов, мирный договор подписан не будет».

В 2005 г. президент России Владимир Путин выразил готовность разрешить территориальный спор в соответствии с положениями декларации 1956 года, то есть передав Японии Хабомаи и Шикотан, однако японская сторона не согласилась на компромисс.